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La gentiane pourpre est considérée comme rare à très rare en Savoie et Haute-Savoie par Rameau et all. Flore forestière française.
Espèce orophyte ouest-européen, elle est présente dans les Alpes (de la Savoie jusqu'au Tirol septentrional) et en Scandinavie.
Hegi (Illustrierte Flora von Mitteleuropa, 1975) l'indique également au Kamtchatka sous une variété Camtschatica Grisebach.
Elle se trouve dans les brousses d'arbustes nains à l'étage subalpin supérieur dans les Alpes.
On la trouve également dans les mégaphorbiaies et les pelouses de l'étage alpin (jusqu'à 2450 m) :
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